La Ministra de Cultura y Comunicación decidió, en junio de 2016, cerrar este sitio y redesplegar las misiones de los Archivos Nacionales en dos sitios: uno patrimonial, en el Cuadrilátero Rohan-Soubise en París; el otro contemporáneo e inscrito en el Gran París, en Pierrefitte-sur-Seine.
La segunda ola de transferencia de los fondos de archivo al sitio de Pierrefitte-sur-Seine, en almacenes en curso de equipamiento, comenzó en el segundo semestre de 2019 y debería terminar en 2021. Estas transferencias requieren importantes trabajos previos. Durante este período, los fondos, hoy conservados en el sitio de Fontainebleau, ya no son accesibles. La apertura a la consulta de los fondos transferidos está prevista de 2020 a 2021, en función del calendario de traslado a Pierrefitte.