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Ancienne élève de l'École nationale des chartes, archiviste paléographe et conservatrice générale du patrimoine, Françoise Banat-Berger a travaillé aux Archives de Paris puis a dirigé le Service des archives au ministère de la Justice où elle a travaillé notamment sur l'évolution de droit de la preuve dans l'environnement numérique et sur les questions d'archivage numérique.

Elle a ensuite dirigé, au sein des Archives de France, la sous-direction de la politique interministérielle et territoriale pour les archives traditionnelles et numériques. Elle a été directrice des Archives nationales de 2014 à 2019.

Elle est aujourd'hui Cheffe du Service interministériel des Archives de France (SIAF).