La villa gallo-romaine de Montcaret a semble-t-il connu pas moins de quatre états successifs : c'est ce qui ressort des différentes campagnes de fouilles et/ou conséquences de travaux d'entretien, d'assainissement, d'électricité ou d'agrandissement du musée. En effet, ces recherches ont permis de préciser le plan et l'extension des vestiges de la villa.

Ne sont visibles actuellement que les fondations de la partie habitation (pars urbana) d'une riche villa gallo-romaine qui vit le jour à Montcaret autour du Ier siècle de notre ère. Elle a connu son extension maximale dans la seconde moitié du IVème siècle.
Or, l'Empire romain déclinant et devant faire face aux invasions barbares, elle a sans doute été désertée. Du VIème au XIème siècles, on est confronté à un " vide historique " : en effet, les éléments dont nous disposons sont trop incertains pour que nous puissions établir un historique quelconque.
On sait qu'au XIème siècle, des moines bénédictins ont utilisé la villa comme carrière de pierres : les murs Est de l'église (chœur) en témoignent. Puis, comme c'était l'usage, les lieux ont servi de cimetière. Les nombreuses sépultures et pierres tombales retrouvées sur place en attestent.