L’église de Morteau, dédiée à saint Antoine et saint Sulpice, dépendait depuis le XIIe siècle de la paroisse d’Andelot. L’abbé de la Crête en partageait les dîmes avec l’abbé du Val des Ecoliers. Le village de Morteau est détruit par la guerre de Cent ans. En 1489 on le décrit comme « tout en ruine, haies et buissons, sans édifice excepté l’église ». Les quelques reconstructions du XVIe siècle furent anéanties par la guerre en 1652 et le village fut alors abandonné. L’église cependant subsista, un ermite s’y installa et un pèlerinage célébrait la fête de saint Sulpice. Celui-ci fut supprimé en 1849.
L’église date du XIIe siècle. Elle se compose d’une nef plafonnée et d’un chœur, d’une travée à chevet plat, voûté en berceau. Contre la façade Ouest est placé le petit logement de l’ermite. Le porche a été ajouté au XIXe siècle.
Inscription le 17 novembre 2010.
